Съвместният надзорен орган за Митническата информационна система е създаден на основание член 18 от Конвенцията за използване на информационните технологии за митнически цели като орган, компетентен по въпросите, свързани с надзор на митническата информационна система.
Състои се от двама представители от всяка страна-членка, които се предлагат от независимите национални надзорни органи по защита на данните.
Съвместният надзорен орган за Митническата информационна система има следните задачи:
· надзор по използването на Митническата информационна система;
· изследването на трудностите при прилагане и тълкуване, които могат да възникнат при използването на Митническата информационна система;
· изследване на проблемите, които могат да възникнат по отношение на упражняването на независим надзор от националните надзорни органи на страните-членки;
· разглеждане на проблемите, които могат да възникнат при упражняване на правото на достъп на лицата до системата;
· изготвянето на предложения с оглед намирането на общи решения на проблемите;
· изготвяне на становища относно адекватността на мерките за защита на данните.
Представител на България в Съвместния надзорен орган за Митническата информационна система е членът на Комисията за защита на личните данни проф. Веселин Целков.